Constituem o conjunto de patrimônio tombado da UFRJ as seguintes edificações ou suas partes integrantes:
- Edifício do Colégio Brasileiro de Altos Estudos (CBAE), localizado à Av. Rui Barbosa, 762, Flamengo, Rio de Janeiro, RJ.
- Pavilhão de Aulas da Escola de Enfermagem Anna Nery (EEAN), situado à Rua Afonso Cavalcanti, 275, Cidade Nova, Rio de Janeiro, RJ.
- Edifício da Escola de Música (EM), situado à Rua do Passeio, 98, Centro, Rio de Janeiro, RJ, incluindo o Painel Paisagem Urbana, localizado na fachada lateral.
- Edifício Jorge Machado Moreira, sede da Faculdade de Arquitetura e Urbanismo (FAU), incluindo o paisagismo e o painel externo em concreto de Roberto Burle Marx, localizado à Av. Pedro Calmon, 550, Cidade Universitária, Rio de Janeiro, RJ, no campus Cidade Universitária.
- Edifício da Faculdade Nacional de Direito (FND), situado à Rua Moncorvo Filho, 8, Centro, Rio de Janeiro, RJ.
- Edifício (pavilhões originais) do Instituto de Atenção à Saúde São Francisco de Assis (antigo Hospital Escola São Francisco de Assis – HESFA), situado à Av. Presidente Vargas, 2.863, Cidade Nova, Rio de Janeiro, RJ.
- Edifício do Instituto de Filosofia e Ciências Sociais (Ifcs), localizado no Largo de São Francisco de Paula, 1, Centro, Rio de Janeiro, RJ (antiga Escola Nacional de Engenharia).
- Instituto de Puericultura e Pediatria Martagão Gesteira (IPPMG), incluindo o paisagismo e painel de azulejo de Roberto Burle Marx (IPPMG), situado à Rua Bruno Lobo, 50, Cidade Universitária, Rio de Janeiro, RJ, no campus Cidade Universitária. – O decreto de tombamento efetivo é do Paisagismo de Burle Marx, porém a UFRJ foi formalmente notificada quanto ao tombamento do edifício: Ofício n. 21/2016 (13.set.2016), do IRPH: notifica o prosseguimento do tombamento definitivo do IPPMG (proc. 01/004138/2015); e Ofício n. 262/2018 (17.dez.2018), do Instituto Estadual do Patrimônio Cultural – INPEC (órgão de tombamento estadual): sobre o início do tombamento provisório do IPPMG (proc. E-18/001/100411/2018).
- Edifício do Museu Nacional, inclusive a Coleção Arqueológica Balbino de Freitas, situado à Quinta da Boa Vista, s/n, São Cristóvão, Rio de Janeiro, RJ.
- Conjunto do Horto Botânico do Museu Nacional, situado à Quinta da Boa Vista, s/n, São Cristóvão, Rio de Janeiro, RJ – O Horto é a área de responsabilidade da UFRJ na Quinta da Boa Vista, sobre a qual incide o tombamento de conjunto da Quinta pelo IPHAN.
- Conjunto Paisagístico do Observatório do Valongo (OV), situado à Ladeira Pedro Antônio, 43, Saúde, Rio de Janeiro, RJ.
- Edifício do Palácio Universitário, localizado no campus Praia Vermelha, à Av. Pasteur, 250, Urca, Rio de Janeiro, RJ (antigo Hospital Nacional de Alienados).
- Conjunto histórico da Praia Vermelha, incluindo o edifício sede do Teatro Qorpo Santo e dois sobrados localizados no campus Praia Vermelha, situado à Av. Pasteur, 250, Urca, Rio de Janeiro, RJ, considerados como Núcleo de Especial Interesse de Preservação, sendo construções remanescentes do antigo Hospital Nacional dos Alienados, onde atualmente funciona o Instituto de Psiquiatria (Ipub) e também se situa o Diretório Central dos Estudantes, anexo à Escola de Serviço Social (ESS) e ao Instituto de Psicologia (IP). – O IPHAN está reavaliando o processo de tombamento do Palácio Universitário, propondo um tombamento de conjunto que engloba: Fundação José Bonifácio, diretório Central de Estudantes Mário Prata, Anexo da Escola de Serviço Social, Instituto de Psicologia, Anexos do Instituto de Psiquiatria (Residência Médica, Serviço de Psiquiatria da Infância e Adolescência, Teatro Qorpo Santos)
Tombamento de trechos remanescentes do muro histórico. - Edifício situado à Rua Luís de Camões, 68, Centro, Rio de Janeiro, RJ, onde funciona o Centro Cultural Hélio Oiticica, da Prefeitura da Cidade do Rio de Janeiro.
- Edifício da Antiga Escola de Eletrotécnica, situado à Praça da República, 22, Centro, Rio de Janeiro, RJ.
- Edifício da Fundação Universitária José Bonifácio (Fujb), localizado à Av. Pasteur, 280, Urca, Rio de Janeiro, RJ, no campus Praia Vermelha.